Η Περιφέρεια Βορείου Αιγαίου βρίσκεται στο βορειοανατολικό άκρο της Ελλάδας και Noτιοανατολικό σύνορο της Ευρωπαϊκής Ένωσης και περιλαμβάνει 3 νομούς, τον Νομό Λέσβου (17 Δήμοι και 1 κοινότητα), τον Νομό Χίου (10 Δήμοι) και τον Νομό Σάμου (8 Δήμοι).
Η περιφέρεια περιλαμβάνει 9 νησιά μικρού, μεγάλου και μεσαίου μεγέθους. Τα νησιά που ανήκουν στην περιφέρεια είναι διάσπαρτα στο βορειοανατολικό τμήμα του Αιγαίου Αρχιπελάγους, τα περισσότερα από αυτά βρίσκονται κατά μήκος των ακτών της Μικράς Ασίας και αποτελούν το ανατολικό σύνορο της Ευρωπαϊκής Ένωσης με την Τουρκία.
Έδρα της Περιφέρειας Βορείου Αιγαίου είναι η Μυτιλήνη.